La ASEM está regida por la Junta de Entidades Participantes, compuesta por los jefes de las Agencias que mantienen instituciones consumidoras en el Centro Médico de Puerto Rico, presidida por el Secretario de Salud del Estado Libre Asociado de Puerto Rico.
La organización tiene un Director Ejecutivo nombrado por el Secretario de salud, con el consejo de la Junta de Entidades Participantes y con la aprobación del Sr. Gobernador de P.R.. El Director es el primer ejecutivo de la Administración y desempeña los deberes que le delegue el Secretario, según la Ley.
instrumentalidad del Gobierno del Estado Libre Asociado de Puerto Rico.
El Hospital Industrial inició operaciones, en las instalaciones que actualmente ocupa, el 6 de junio de 1967. A tal fin, se le concedió una licencia para operar 271 camas en el Centro Médico. El Hospital Industrial se convirtió en la primera institución hospitalaria en Puerto Rico en contar con un Departamento de Medicina Física y Rehabilitación integrado a un hospital. Esta institución gubernamental se creó para ofrecer servicios de hospitalización, tratamiento médico-quirúrgico y de rehabilitación a los trabajadores que sufren accidentes en el trabajo o enfermedades ocupacionales, como parte de los beneficios que ofrece la Corporación del Fondo del Seguro del Estado (CFSE).
El Hospital Pediátrico Universitario, (HOPU),
Es el único hospital pediátrico supra terciario en Puerto Rico donde se atienden a los pacientes más complicados de salud. Además es el hospital docente de la Universidad de Puerto Rico donde se entrenan nuestros futuros médicos.
El Hospital Universitario sirve como taller de enseñanza a los diferentes profesionales de la salud en entrenamiento, tales como: médicos, enfermeras, dietistas, farmacéuticos, administradores de servicios de salud, educadores en salud, técnicos y otros. Esta Institución promueve la investigación clínica como vehículo para mejorar el tratamiento de sus pacientes. El Hospital es administrado por el Departamento de Salud y está afiliado al Recinto de Ciencias Médicas de la Universidad de Puerto Rico.
Prevenir, restaurar y mantener la salud física, dental y mental de la población penal bajo la custodia de la Administración de Corrección, proveyéndoles servicios de salud de primarios, secundarios y terciarios. El tratamiento socio-médico.